Je zde kontinentální i atlantické podnebí. Přes sdílení podobného klima jako v regionu Alta, Rioja Alavesa produkuje vína s plnějším tělem a vyšší kyselinkou. Vinice v této oblasti mají nízkou hustotu révy s velkými mezerami mezi řádky a to pro velkou konkurenci rostlin, neboť půda zde není příliš bohatá na živiny.